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Points of Significance: Regression diagnostics

Significance系列,该系列主要介绍统计在生物学中的应用,让读者可以更正确的理解及使用统计。有研究发现,在医学类期刊上发表的文章中,有接近半数的统计方法的使用都是不正确的,所以Nature
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Points of Significance: Analyzing outliers: influential or n

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Points of Significance: 多元线性回归

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Points of Significance: 一元线性回归

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Points of Significance: Association, correlation and causati

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Points of Significance: 贝叶斯网络

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Points of Significance: 贝叶斯统计

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Points of Significance: 贝叶斯公式

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Points of View: Analysis of variance and blocking

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Points of Significance: 对照实验设计

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Points of Significance: 非参数检验

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Points of Significance: multiple-testing correction

如上图b左边的图所示,假如图a右边一列基因表达有10%的基因收到影响,在总共有10000个基因的情况下,且检验效应为80%,alpha为0.05时,将会有1250个基因会被检验出来p值小于0.05。
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Points of Significance: Comparing samples – part I

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Points of Significance: Visualizing samples with box plots

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Points of Significance: Power and sample size

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Points of Significance: Significance, P values and t-tests

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Points of Significance: Error bars

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3D Genome可视化工具

然而,由于其预处理生成的.hic文件中已经含有例如5k,10k,20k,40k这种分辨率的信息,所以,调整图比较需要花心思,同时,也不太容易把例如Hi-C,ChIA-PET的数据放到一张图里比较。
2017年4月10日
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Importance of being uncertain

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