菌群怎样影响疫苗的免疫效果？| 热心肠日报
今天是第1304期日报。
Science：菌群如何影响人体对疫苗的免疫应答
Science[IF:41.037]
① 在接种灭活季节性流感疫苗的健康成年人中，编码TLR5的基因的早期表达与抗体应答及血液转录组应答相关；② 在TLR5敲除小鼠中的研究揭示，菌群可能作为“内源性佐剂”促进人体对疫苗的应答；③ 广谱抗生素可降低健康人接种灭活季节性流感疫苗后对H1N1病毒的IgG1及IgA应答，提示菌群可促进人体对疫苗的适应性免疫应答；④ 抗生素处理增强人体对疫苗的先天性免疫应答，菌群通过代谢产生次级胆汁酸抑制AP-1相关基因的表达及NLRP3炎症小体的活化。
Immunology taught by vaccines
11-29, doi: 10.1126/science.aau6975
【主编评语】哪些因素影响了人体对疫苗的免疫应答尚未明确，一些研究认为菌群对疫苗引起的人体免疫应答具有调节作用。Science上发表的一篇perspective，详细介绍了在临床试验及动物实验中，菌群如何影响机体在接种疫苗后产生的先天性及适应性免疫应答，为今后的疫苗研发提供了新的研究思路。（@szx）
Nature：胆汁酸代谢产物调控Th17细胞与Treg的分化
Nature[IF:43.07]
① 对胆汁酸代谢产物文库进行筛选，鉴定出2种不同的石胆酸（LCA）衍生物——3-oxoLCA与isoalloLCA对分离自小鼠的T细胞起到调控作用；② 3-oxoLCA通过直接结合关键转录因子RORγt，以抑制Th17细胞的分化；③ isoalloLCA通过诱导线粒体活性氧的产生，促进Treg的分化，isoalloLCA介导的Treg分化需要内源性Foxp3增强子——保守非编码序列3的参与；④ 在小鼠肠道固有层中，3-oxoLCA及isoalloLCA处理可分别降低Th17细胞的分化或促进Treg的分化。
Bile acid metabolites control TH17 and Treg cell differentiation
11-27, doi: 10.1038/s41586-019-1785-z
【主编评语】胆汁酸可影响宿主代谢、癌症进展及先天性免疫，但其对适应性免疫细胞（如Th17细胞及Treg）的影响尚未明确。来自Nature上发表的一项最新研究，筛选鉴定出2种石胆酸代谢产物——3-oxoLCA与isoalloLCA，可分别抑制Th17细胞的分化，或促进Treg的分化。（@szx）
Nature Reviews：如何对IBD患者进行个性化医疗（综述）
Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology[IF:23.57]
① 近年来出现了3种类型的新药用于治疗IBD：靶向白细胞迁移（维多珠单抗等）、靶向IL-12p40、TNF等关键细胞因子（优特克单抗等）、抑制细胞因子信号通路（托法替尼）；② 这些药物均可能出现原发性无应答及继发性失应答，因此急需开发个性化治疗策略，以鉴定患者应该使用哪一类治疗药物；③ 结合体内实时分子内窥镜技术、组织转录组学分析、遗传学研究、肠道菌群分析及免疫应答通路分析，或可综合预测患者对特定药物的应答。
Interrogating host immunity to predict treatment response in inflammatory bowel disease
11-25, doi: 10.1038/s41575-019-0228-5
【主编评语】目前治疗IBD的药物可分类为多种作用机制，但IBD患者可能对某些药物的治疗无应答。Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology上发表的一篇综述文章，详细介绍了各类IBD治疗药物的作用机制，并讨论了如何结合分子内窥镜技术、转录组学、遗传学、肠道菌群分析、免疫应答通路分析等手段，以预测IBD患者对不同治疗药物的应答。（@szx）
来氟米特或可用于治疗TTC7A基因缺陷引起的IBD
Gastroenterology[IF:19.233]
① 在TTC7A敲除的HAP1细胞（人单倍体细胞）中，对FDA已批准的药物进行高通量筛选；② TTC7A敲除的HAP1细胞中活性caspase-3及caspase-7的水平增加，因此表现出异常形态及凋亡表型；③ 鉴定出来氟米特（一种用于治疗类风湿关节炎的药物）可增加TTC7A敲除的HAP1细胞的活性，并降低caspase-3及caspase-7的活性（降低幅度可达96%）；④ 在TTC7A敲除的斑马鱼中，来氟米特可增加肠道运动、降低肠道狭窄、促进肠道细胞存活、恢复绒毛及杯状细胞形态。
Drug Screen Identifies Leflunomide for Treatment of Inflammatory Bowel Diseases Caused by TTC7A Deficiency
11-16, doi: 10.1053/j.gastro.2019.11.019
【主编评语】TTC7A基因突变可造成肠道上皮及免疫缺陷，并引发小肠结肠炎、肠闭锁、复发性肠狭窄等肠道疾病。Gastroenterology上发表的一项最新研究，通过对FDA已批准的药物进行高通量筛选，发现在细胞系、斑马鱼及患者来源的结肠类器官中，一种用于治疗类风湿关节炎的药物——来氟米特，可抑制TTC7A基因缺失引起的细胞凋亡，增加肠道细胞的存活，恢复恢复肠道功能。（@szx）
共生菌群驱动结肠巨噬细胞的功能多样化
Mucosal Immunology[IF:7.352]
① 对SPF小鼠及无菌小鼠的结肠髓系细胞进行单细胞RNA测序，揭示结肠巨噬细胞及树突细胞的异质性；② 相比于SPF小鼠，无菌小鼠的结肠总巨噬细胞数量减少，CD11c+ CD206int CD121b+ 及CD11c− CD206hi CD121b− 结肠巨噬细胞比例降低；③ 与其它结肠巨噬细胞亚群相比，上述两个结肠巨噬细胞亚群有着不同的基因表达谱，定位于固有层，并可吞噬来自血液中的大分子；④ 无菌小鼠与SPF小鼠的结肠树突细胞数量及比例无显著差异。
Commensal microbiota drive the functional diversification of colon macrophages
11-26, doi: 10.1038/s41385-019-0228-3
【主编评语】Mucosal Immunology上发表的一项最新研究，对比分析了SPF小鼠与无菌小鼠的结肠巨噬细胞，发现无菌小鼠的两个结肠巨噬细胞亚群的比例降低，提示共生菌群在结肠巨噬细胞的功能分化。（@szx）
粪便中性粒细胞弹性蛋白酶或可用于评估IBD患者的疾病严重程度
Mucosal Immunology[IF:7.352]
① 在鼠柠檬酸杆菌诱导的小鼠结肠炎模型、DSS诱导的小鼠结肠炎模型及IBD患者样本中，发现粪便中性粒细胞弹性蛋白酶（NE）活性可反映疾病严重程度；② 鼠柠檬酸杆菌感染期间，肠道上皮细胞分泌丝氨酸蛋白酶抑制剂SerpinA3N以抑制胞外NE造成的组织损伤；③ 严重结肠炎小鼠的SerpinA3N分泌不足；④ 可分泌SerpinA3N的重组鼠柠檬酸杆菌感染小鼠后，组织损伤降低；⑤ 使用NE鉴别活动性及非活动性溃疡性结肠炎患者，准确性类似钙网蛋白（AUC=0.8681）。
Faecal neutrophil elastase-antiprotease balance reflects colitis severity
11-26, doi: 10.1038/s41385-019-0235-4
【主编评语】IBD的特征之一为中性粒细胞的肠道浸润。Mucosal Immunology上发表的一项最新研究，在结肠炎小鼠模型及IBD患者中均发现，粪便中性粒细胞弹性蛋白酶（NE）与疾病严重程度密切相关。在鼠柠檬酸杆菌感染诱导的小鼠结肠炎模型中，SerpinA3N（可抑制NE活性的蛋白酶抑制剂）可缓解NE造成的组织损伤。因此，NE或可作为评估IBD患者的疾病严重程度的生物标志物，以及IBD的潜在治疗靶点。（@szx）
靶向线粒体PPARα或可恢复HIV感染引起的肠道屏障受损
PNAS[IF:9.58]
① 在非人灵长类动物中，SIV感染导致粘膜IL-1β表达增加及肠道上皮屏障受损；② SIV感染引起的线粒体功能受损（表现为脂肪酸β-氧化受到抑制）是造成肠道屏障功能失调的背后机制；③ 在未接受抗逆转录病毒治疗的情况下，植物乳杆菌处理可快速修复因SIV感染而受损的肠道屏障，但不影响粘膜CD4+ T细胞的数量；④ 植物乳杆菌通过诱导过氧化物酶体增殖物激活受体α（PPARα）信号的活化，介导了对肠道屏障的修复作用。
PPARα-targeted mitochondrial bioenergetics mediate repair of intestinal barriers at the host–microbe intersection during SIV infection
11-18, doi: 10.1073/pnas.1908977116
【主编评语】HIV感染早期可减少粘膜CD4+ T细胞并导致肠道上皮屏障受损，抗逆转录病毒治疗可抑制HIV病毒，但无法修复“肠漏”。来自PNAS上发表的一项最新研究，发现在HIV感染的恒河猴模型中，肠道屏障功能受损伴随着线粒体功能失调，植物乳杆菌可通过靶向PPARα信号，修复线粒体的脂肪酸β-氧化并恢复肠道屏障功能。（@szx）
痢疾阿米巴增强宿主先天性免疫应答的机制
Mucosal Immunology[IF:7.352]
① 痢疾阿米巴（Eh）感染诱导巨噬细胞迅速释放警报素分子HMGB1，HMGB1的释放依赖于活性Eh与细胞表面半乳糖凝集素的接触；② 机制上，Eh激活PI3K与NF-κB信号通路，上调组蛋白乙酰化酶活性，诱导HMGB1的乙酰化，促进巨噬细胞中的HMGB1从核内转运至细胞质，并被分泌至胞外与Eh结合；③ 敲低HMGB1，可在THP-1细胞系中降低促炎症因子的表达；④ SPF小鼠（而非无菌小鼠）感染Eh后，HMGB1单抗处理可抑制TNF-α、IL-1β等炎症因子的表达升高。
Entamoeba histolytica stimulates the alarmin molecule HMGB1 from macrophages to amplify innate host defenses
11-26, doi: 10.1038/s41385-019-0233-6
【主编评语】痢疾阿米巴诱导宿主的促炎症性应答，但影响宿主应答的调控因素尚未明确。Mucosal Immunology上发表的一项最新研究，发现痢疾阿米巴感染后，可促进巨噬细胞分泌警报素分子——HMGB1，以增强炎症因子应答。（@szx）
感谢本期日报的创作者：szx
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