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临床数据统计|小看你了,jamovi!!!

Roger 不言 劝人学医TDLP 2023-03-23


之前有一期专门给大家介绍了jamovi做临床数据统计分析。相比于spss,jamovi操作界面简单友好,并且可以提供很多组件用于临床数据统计分析、meta分析等常用分析方法。最主要的是,jamovi做出的图表基本也是发表级的。今天再次回到jamovi,进入ClinicoPath后发现在统计临床数据统计描述组件中,用jamovi尽然可以做出桑基图金字塔图变量树等高颜值统计描述图片。我们只需要读入数据,选择响应模块,点点鼠标后保存即可。详细看看吧。


1.统计描述——描述性统计图

读入数据,调整变量后我们点击探索按钮,在你安装了ClinicoPath组件后就会发现探索下面的功能要比之前更加丰富了。


这里,我们点击survey plots,看一下这个功能。


这个模块主要提供对数据的简单描述性统计可视化,主要分为分类变量和连续性变量。在变量框里选择变量后会自动识别变量类型。对于分类变量,主要通过条形图进行可视化(成组/堆叠),通过其他参数可以设置数值的展现方式和部位。对于连续性变量,这里可以通过“云雨图”进行可视化。上图示例是单个组,我们也可以加入分组变量。如在下图中我们将手术治疗与否设为分组变量,不同分组之间患者的生存状态和生存时间显而易见。


2.统计描述——桑基图

目前我指导的桑基图主要是利用R或一些shinyapp做的。jamovi里面的这个插件提供了桑基图数据可视化功能,并且显而易见,这并没有影响到他的颜值。


点击桑基图模块后,我们选择需要展示的变量。例如我想看不同性别、婚姻状态、分级、有无手术和化疗的病人的生存状态,只需要依次选入变量即可。图片导出方式同前,不在详细介绍。


3.统计描述——年龄-性别金字塔图

jamovi还提供了金字塔图。但是目前只能做年龄-性别金字塔图,即只限于这两个变量。进入模块后依次正确选择变量即可。如果想要用金字塔图探索其他变量之间的关系,可以用R。


4.统计描述——变量树

进入到变量树组件后可以看到以下界面,可以依次选择分类变量或连续性变量绘制变量树。变量最好不要选择太多,不然最后的树会比较难看。


以下为一个简单的变量树。现在越发觉得jamovi在临床数据统计这一块还是很出色的。但是好像他的包的更新速度很慢。不像R,同样为开源软件,但是包的更新速度很快,就一天就有很多个新包发布或者旧包更新。但是我还是相信jamovi的发展潜力仍然巨大。应用好jamovi里面的组件,会帮你减轻很多统计描述和统计分析的工作。


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