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[例行抢跑] 巴塞尔报告(第四期,2022年9月2日)

拍老师 拍帮主 2022-10-06

 前言

各位早上好中午好下午好晚上好~
不知不觉,每两周一期的瑞士内参,又双叒叕登场啦!(上期回顾:《 巴塞尔报告(第三期,2022年8月19日)》


总之,鉴于这份内参更新还挺稳定,抢跑速度也够快(Pango委员会内部成员自编自导),干脆后咱就直接拿这货来作为定期变异株现状报告了吧。


在正式搬运瑞士内参之前,先走一张最近值得关注新发变异株的图例。
——请品鉴啦:↑ Peacock老师的新作,被咱无耻地抢跑了,还顺手打了水印……
简单解释一嘴:
  • 上图左边是Omicron流行期以来的历代主流毒株,即BA.1、BA.2、BA.4/5,以及BA.2.75(是的你们没看错,Peacock老师已经钦定BA.2.75是下一代毒王了)
  • 然后,上图右边则是近期造型最阴间的几个新发变异株,即BA.2.75.2、BJ.1、BA.2.10.4以及BA.2.3.20(印度一家占了四分之三可还行?)
  • 每一个变异株上边的长横条是刺突蛋白全长,以及除了RBD结构域之外的突变列表;
  • 最后,每一个变异株下边的短横条,则是刺突蛋白RBD结构域,以及位于RBD的突变列表。

很凑巧,下面将会搬运的瑞士内参,也会提到上图右边那四款阴间变异株~



第一部分,BA.2.75正在快速获得多个额外的增益性刺突蛋白突变

局势已经越来越明朗,

哪怕适应性最佳的BA.5代表队的最强选手,如今也卷不过BA.2.75了……

原因在于——BA.2.75获得刺突蛋白增益性突变的效率更高。


虽然元祖版BA.2.75也许还比不上BA.5代表队的后起之秀(比如BF.7之类,也就是BA.5.2.1加额外的刺突蛋白R346T),

但是BA.2.75代表队也有后起之秀好伐!

并且憋出新的增益突变的速度还更快,怎么破?

具体见下:

  • R346T,增益突变,免疫逃逸系,现已被BL.1(即BA.2.75.1.1)和BA.2.75.2拾取绑定,并成功发挥出每天4-8%的额外相对增长优势
  • K356T超强增益突变,免疫逃逸系,现已被BA.2.75.5拾取绑定,等价于每天5-10%的额外相对增长优势;
  • F486S,超强增益突变,免疫逃逸系,现已被BA.2.75.2拾取绑定,等价于每天5-10%的额外相对增长优势;
  • D574V,增益突变,属性不明,相当于3-4%的额外相对增长优势,已被BA.2.75.1拾取绑定。


所以情况就是这么个情况,

在刺突蛋白RBD结构域,

BA.2.75的突变方向大致与BA.4/BA.5趋同,

然而两边憋大招的进度条速度却完全不一样……


最后,Cornelius小哥贩卖了一颗毫无根据的定心丸:

大概可能也许上述增益性突变是限量供应的?抢完了后面就没了?

(拍老师的画外音:Naive!)




第二部分,值得关注的BA.2.75子毒株

截至目前,下面几款BA.2.75子毒株相对增长速度最快,预计将在近几个月霸榜:

  • BA.2.75.2(特征定义突变:S:R346T, S:F486S, S:D1199N),相对于原始版BA.2.75的增长优势高达每天10-15%左右;

  • BL.1(特征定义突变:S:R346T, S:D574V),相对于原始版BA.2.75的增长优势高达每天5-10%左右;

  • BA.2.75.3(特征定义突变:S:K356T),相对于原始版BA.2.75的增长优势高达每天5-10%左右。

(拍老师的画外音:补充一嘴,BA.2.75家族最新成员刚刚获得命名,即BN.1,特征定义突变:S:R346T+S:R346T+S:490S,可还行?)


总之,如果每天相对增长优势为10%,

则市占率将在6个星期左右从1%增长到50%~

(5%增长优势则需要3个月,3%增长优势则需要5个月)。

因此,Cornelius小哥预测:


BA.2.75将在10月底成为全球主流毒株。


——请品鉴:

↑ 解释一嘴,

以上是用cov-spectrum估算的,

拥有上述几种额外增益性刺突蛋白突变的BA.2.75子毒株,

相对于原始版BA.2.75的每周增长优势。

并且拥有上述增益突变的子毒株们,在刚刚冒头的第一个月时间里,

市占率已经涨到了10%以上。


另外,说到cov-spectrum,跑个题,

以下是今天新鲜更新的cov-spectrum版相对增速排行榜~

(对比标杆是原始版BA.5)


——请品鉴(可能需要点开大图):




第三部分,BA.5代表队的增益性刺突蛋白突变一览具体见下:
  • S:R346T (BA.2.75.2, BL.1, BA.4.6, BF.7, BF.11, BE.1.2, BA.5.2.6都带了这玩意儿)

  • S:R346S (BA.4.7, BF.13拾取绑定)

  • S:K444M (BA.5.2.7)

  • S:K444T (BE.1.1.1, BA.5.6.2)

  • S:K444R (BF.16)

  • S:N450D (BA.5.5.1, BF.14)

  • S:A1020S (BF.3.1, BF.5)




第四部分,本期阴间变异株大奖得主

详见最上边Peacock老师抢跑图的右下处,

最新款阴间变异株:BA.2.3.20

虽然截止现在只有5条序列,

却已经华丽丽地分布在三个大洲(美国、土澳和新加坡同时检出可还行?)

大佬们推测,这货有可能起源于印尼或大马,

然后美帝土澳坡县三地检出的都是输入相关病例。


——撸一撸树,请品鉴:

这长长的branch……


——相对于BA.2的额外突变列表,请再品鉴:

这写都写不下的密密麻麻的突变们……


以上,搬运完毕!




第五部分,照惯例夹带一点私货

↑ 最新阴间变异株一例,太新了以至于都没来得及入选瑞士内参……
简单来说,上面是BA.1.22的某子毒株~在秘鲁检出。
——相对于BA.1的额外突变列表,请品鉴啦:正可谓:狼烟四起,四境不宁,暗流涌动,轮流上阵。


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