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[搬运工] 激战!流感VS新冠!(演化路径篇)

拍老师 拍帮主 2022-11-05

前言

各位早上好中午好下午好晚上好~今天有点其他事儿要忙,没啥时间写东西,所以直接搬运一篇知乎内容应付一下吧~不过虽说是应付,但含焦量应该还是有保证的,
请各位不要嫌弃
另外,《流感VS新冠》系列的前几集请见《流感 VS 新冠!(大英官方POV)》《激战!流感VS新冠!(小祖宗POV)》
《激战!流感VS新冠!(狼狈为奸篇)》
《激战!流感VS新冠!(流感POV)》


话说,为什么各位大佬只喜欢强调新冠病毒变异?为什么相对来说不太强调普通感冒病毒和流感病毒变异?这个问题的本质,其实跟变异速率没有几毛钱关系。对比下面几张图就知道了。(关键词:梯子)

——请首先品鉴:

以上是甲流H3N2的系统发生树。
——请再品鉴:再品鉴:↑ 人冠状病毒229E系统发生树

以上两棵树是不是看起来眼花缭乱的?

没关系,

已经有大佬帮咱们简化过了。


——请继续品鉴:

↑ 简化过的甲流和229E系统发生树


解释一嘴: 

以上简化,不是咱搞的,而是经常被咱公众号搬运的常客,演化生物学全球顶流大佬,哈金森研究所Jessie Bloom老师搞的;

Jessie桑表示,CoV-229E跟甲流H3N2的树,简化之后都差不多是这么个造型;

Jessie桑又表示:为啥这树都不约而同长得跟梯子似的?这是因为,229E和H3N2新旧交替的模式都差不多,都是适应性最好的主流毒株,通过抗原漂变机制,变异出下一代主流毒株;

Jessie桑接着表示:这种梯子形状的树有啥妙处?其妙处就在于,抗原漂变的方向,在一定程度上是可以预测的,并且可以连猜带蒙提前准备好疫苗。 


——沿着梯子更新流感疫苗,请品鉴:




看完了甲流和229E的模式,下面再看看其他情况。


——换个例子,请接着品鉴:

↑ 人冠状病毒OC43系统发生树

看着眼花缭乱的是不?没关系,Jesse桑又出手了。
——请再品鉴:↑ 简化过的OC43系统发生树
继续解释一嘴:
  • 以上简化又是Jessie桑的手笔;
  • Jessie桑表示,OC43当初分化成了两个株系,然后两个株系都照着梯子形状在演化;
  • Jessie桑又表示,乙流差不多也是这种造型;
  • Jessie桑继续表示:就算分成了两个梯子,也可以连蒙带猜提前准备好疫苗,只不过单价变二价而已,不算麻烦。



OK,重点来了。
——请最后品鉴:↑ 新冠病毒系统发生树
——请对比品鉴:↑ 简化过后的新冠病毒系统发生树(红框部分)
所以,这乱成一团麻的演化树是个什么鬼?靠着这么一棵树,怎么连蒙带猜?怎么判断提前量搞疫苗?那些撸树撸了几十年的专业撸手,突然碰到这么一棵树,心里慌不慌?该不该强调新冠变异?连Jessie桑这样的撸树界大佬都心里发慌,往死里强调新冠变异,咱们这些无名小学渣跟风起个哄,有什么毛病吗?


下面是例行贩卖焦虑环节。
新冠病毒那种形状的树,其实并不少见。

——举个例子,请品鉴:
按照经典的viral phylodynamics理论,

但凡有选择压力的演化树,天生就应该是一副梯子造型(图A),

而没有受到选择压力的树,则应该长得跟前面的新冠演化树差不多(图B)~


所以问题就来了,

新冠病毒的演化,明明受到了巨量的选择压。

那么它到底凭什么做到了一边承受选择压一边长出如此不羁的树?


一点猜想:

《今日果·昨日因(重制版)》





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