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[变异毒株]Delta时代的那些非Delta余孽们(中集)

拍老师 拍照稀烂的焦虑怪 2021-11-25

上集见这里:[变异毒株]Delta时代的那些非Delta余孽们(上集)

话说,昨天咱简单八卦了一下VOC(受关注变异株)的三朵过气黄花。
简单回顾一下:
其中Alpha和Gamma还勉强保存了一丢丢日渐萎缩的大本营,
而Beta已然进入流窜作案、零星散发状态,
完全没有了当年四分天下的王霸之气。

但哪怕已经被后浪推前浪,
前浪却拒绝死在沙滩上。
刚好相反,Alpha和Beta各自经历了武林奇遇,
并且洗出了亲妈不认的魔改版本。

今天咱继续品鉴英国卫生安全局《第28期英格兰地区新冠病毒VOC/VUI技术简报》的9种VUI(正在调查的变异株)。

分别是:
  • AY.4.2(Delta徒子徒孙之一)

  • B.1.525(Eta)

  • B.1.617.1(Kappa)

  • B.1.621(Mu)

  • P.2(Zeta)

  • P.3(Theta)

  • B.1.617.3

  • AV.1

  • B.1.1.318




对了,大伙儿会不会觉着上面那堆代号……就跟天书一样?
咱这就插播一个关于变异株名称的名词解释啊。

各位已经知道,新冠病毒的变异毒株层出不穷,
WHO搞的希腊字母命名法完全不够用的……
所以业界一般还是习惯用pango命名法。

用人话来说,pango命名法通常由从左到右3-4个小节组成,
每两个小节中间由分割符"."进行区分。

其中第一个小节是大写字母(一位字母或两位字母都可以),比如说B.1.1.7,或者AY.4.2;
后面几节则全部是数字。

从左到右每个小节,都对应演化树上的一次进化枝分化,
(可以类比初中学的“界门纲目科属种”不断细分)

以“”B.1.617.2”为例,
其中最左边的“B”,代表新冠病毒的B进化枝(当初武汉两种初始毒株之一);
“B.1”则代表B进化枝下的第一个分支;
然后“B.1.617”代表B.1进化枝下的第617个分支;
再然后,“B.1.617.2”代表B.1.617进化枝下的第2个分支。

在变异株名称长度达到4个小节之后,Pango team的老师会约定一个新的专属英文简称,用来专门指代上述4个小节。
比如AY.4.2里边的"AY",指代的就是"B.1.617.2"这4个小节。
所以AY.4.2的意思,就是“B.1.617.2.4.2”。
(或者说,AY.4.2相对于原始株而言,演化树已经分支了6次)

——一图秒懂,请品鉴:




回到主题,
关于《技术简报》里边9种上榜VUI,
一句话总结如下:

  • AY.4.2Delta家族最耀眼的当红新星;

  • Mu是当前新冠病毒江湖仅次于Delta的六边形全能战士(可惜照样不太挡得住Delta的蚕);

  • B.1.1.318是被WHO忽略的实力派干将(可惜还是挡不住Delta的猛攻);

  • 其他六位……则全都是已经过气但暂时没有死在沙滩上的前浪~


说到前浪后浪推前浪,
现如今的《技术简报》清单,其实非常形象地说明了新冠病毒演化至今已经发生的一种范式转换:

  • 在前Delta时代,某种变异株是否牛鼻,需要从多维度评估,比如突变位点吓不吓人、传染性高不高、毒力猛不猛、免疫逃逸强不强,等等;

  • 而在Delta一桶浆糊的现在,判断变异株是否牛鼻的标准已经异常简洁且同质化——只要能继续苟活,不被Delta完全拍死在沙滩上,就是牛鼻,就是强。




下面就一一简单点评几句吧~

B.1.525(Zeta)
这货大概在2020年7月份首次现身尼日利亚。
2021年3月底到达流行率顶峰,约占全球1%的样子~
主要流行范围是以尼日利亚为中心的中部非洲地区,以及美国加拿大;
其中在苏丹实现了超过五成的市占率。

——请品鉴:


这货之所以能喜提WHO专属希腊字母,
主要原因是曾经和B.1.526并称为“纽约变异株”,
共同主导了名噪一时的纽约大爆发~

——请品鉴:

2021年4月份之后,这货逐渐被Delta取代,
现如今只剩零星散发。
WHO专属希腊字母称号也被收回了……
最后一次现身是2021年9月20日(在荷兰)。



B.1.617.1(Kappa)和B.1.617.3
毫无存在感的变异株。
出现的时间不明,盲猜和Delta同时期(吧)……
毕竟印度测序能力感人,搞不明白才是正常情况
入围《技术简报》和喜提WHO专属希腊字母的主要原因,则在于沾了亲兄弟Delta的光……
其中Kappa还勉强有一次拿得出手的爆发记录,也就是2021年5月份导致墨尔本封城两周的那次~
结果被墨尔本超神发挥,反手就给它摁没了,毫无悬念……

——请品鉴:

B.1.617.3则更是默默无闻,毫无亮点。
这两兄弟最后现身都是2021年9月中旬(印度和英国都有
哦对了,B.1.617.1的专属希腊字母也惨遭回收了~



P.2
同样从头到尾都毫无存在感的变异株,同样是希腊字母称号惨遭剥夺的弱鸡。
入围《技术简报》和喜提WHO专属希腊字母的主要原因,照例是沾了亲兄弟P.1(Gamma)的光……
最后一次现身是2021年10月6日(美国佛罗里达州)。



P.3
2021年1月底被日本入境检疫机构挡获,来源于菲律宾
由于长相和同样被日本入境检疫机构挡获的P.1(Gamma)太神似,所以备受重视,
毕竟趋同演化这种事情不是啥好兆头……
但P.3的实际战力似乎差了Gamma几条街~
不过也说不定,
毕竟菲律宾测序工作太一言难尽,所以我们其实并不知道这货在菲律宾境内到底流行到了什么程度,以及现在还有没有继续存活~
另外这货它就是个入境检疫惯犯……
时不时就要在日本/韩国/香港/新加坡等入境检疫刷个存在感~
(这也侧面说明了,菲律宾的主要支柱产业,就是劳务输出
最后一次现身是2021年9月初(日本入境检疫)。



AV.1
不要跟AY.1搞混了……
AY.1是Delta家族的长子长孙(虽然现在看起来挺挫),
而AV.1的全称则是B.1.1.482.1。
这货2021年3月底诞生于英国,
跟上面的P.2、P.3一样,这货完全没有实际战绩,
入围《技术简报》纯粹是因为突变位点看着太唬人,
特别是刺突蛋白部分(打红框的就是看着唬人的部分)~

——请品鉴:

没办法,那时候大伙儿被Beta和Gamma吓破了胆,看到E484K就瑟瑟发抖……

现在这货最大的存在意义,就是作为一个负面典型,
教育刚刚开始跟进变异株演化的postdoc们:
满身阴间突变并不一定厉害,
决定变异株威胁程度的唯一标准,还得看实践检验

AV.1最后一次现身是2021年7月份(在贝宁)



B.1.1.318
简单来说,B.1.1.318是整个VUI清单上仅次于AY.4.2和Mu的强悍存在,
但不知为啥从来没有混到WHO专属希腊字母,
可见WHO是多么地后知后觉……
B.1.1.318于2021年1月初诞生于尼日利亚(又是尼日利亚),
之后顶着当时的全球扛把子Alpha,
陆续抢到了毛里求斯、乌干达、希腊等好几个国家/地区的堂口,
并且直到7月中旬,都有能力在少数地区跟元祖版Delta正面拉锯~

——请品鉴下面这张经典老图:

↑ 上图是荷兰乌特勒支大学Henk-Jan Westeneng老师搞的希腊各变异毒株流行率增长速度多项式拟合(截止2021年7月15日)。
其中,中间的标杆(黑色虚线)是Alpha,
(一代扛把子沦为背景板……)
其他毒株则用黑点表示。黑点上面的黑色线段代表了置信区间,
黑点越靠右,则意味着该毒株相对于alpha的流行率增长率越高。
7月份的希腊,可能是Delta吃瘪最惨的场合……连前三都没挤进去

哦对了,上图排名第二的Other其实就是B.1.1.318的子毒株AZ.2~
Westeneng老师是搞算法的,毒株分类他不太熟,没认出来,
所以一不小心闹了个小笑话,大伙儿请别在意。

总之,正因为B.1.1.318实力不俗,
所以子孙也比较繁茂,共7个,

——请品鉴:


虽然跟接近200个后代的Delta没法比,
或者跟20个后代的Gamma相比也有点差距,
但至少已经是Alpha/Beta的水准了。

故事的结局,B.1.1.318在多个地区刚住了元祖版Delta,
但很快就被更高更快更强的徒子徒孙版Delta推到了沙滩上……
(同样的故事在全球多个地区上演)

只剩下AZ.5(毛里求斯子毒株)一根独苗,
最近刚刚入围WHO的VUM(正在监测的变异株)清单。

不过AZ.5之所以能幸免于难,主要还是因为命好,生在毛里求斯~

毛里求斯啥地方?

全非洲防疫top 2,防疫水平甩了非洲平均水平8条街,甩了英美欧28条街。


——请品鉴:

但虽然身为非洲top2,

毛里求斯还是力有不逮,没法实现社区感染快速清零,

只能一边慢慢解决AZ.5,一边尽量延缓Delta入侵。

结果AZ.5没摁死,Delta的输入和传播又受到限制,

这就相当于阴差阳错,变相保护了本该被Delta长江后浪推前浪的AZ.5……

最终结果就是AZ.5继续在毛里求斯苟活……


至于说突变,AZ.5的突变大致是这么个造型~

——请品鉴:

比原始版B.1.1.318多出了十几个突变,
其中刺突蛋白部分如下
D80Y+A243S+W258L+T859I
基本上可以说是亲妈不认识了……
但比起《技术简报》上藏身于最后一部分的几个大怪物还是有不少差距。
所以估计这一脉的命运差不多就这样到头了(吧)



最后,还剩下Mu和AY.4.2两个大魔头,之前已经专门八卦过了~
见这里:[变异毒株]关于μ(B.1.621)的一些八卦
以及这里:[变异毒株]Delta家族最新动态,AY.4.2特别篇(2021年10月20日更新)
所以就不再重复了。
只简单更新一点最新情况。

其中Mu在南美洲大本营勉强守住了基本盘~

——请品鉴:


AY.4.2则更是在英国稳步扩张,

——请品鉴:

最近甚至还开枝散叶,搞出了后浪AY.4.2.1……

当然了,大伙儿都明白一个浅显道理,
层出不穷的病毒变异,
归根结底,源自于宿主们的无私供奉~
所以Mu所在的南美和AY.4.2所在的英国,可想而知……前景都不太妙~

——比如说,英国:


——南美(以智利为例,其他地方的曲线才刚刚抬头):
↑ 请注意纵轴的坐标系魔法

所以情况就是这么个情况啦,
但凡自己躺平拉胯,
就别怪病毒变异凶猛~
一切都是活JB该。
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