逆转录 (Reverse Transcription)：在逆转录酶 (Reverse Transcriptase) 的催化下以RNA为模板合成DNA的过程；逆转录过程是RNA病毒的复制形式之一，但并不是只有病毒才有逆转录酶，存在逆转录过程；有一种逆转录过程是真核生物必须的，这种逆转录过程发生在端粒的延长机制中。端粒酶以端粒酶RNA的一个片段为模板，合成端粒DNA重复片段，以延长端粒。这个过程发生在有分裂能力的真核细胞的DNA末端，不需要整合酶参与。逆转录病毒会利用逆转录和整合机制入侵宿主细胞，修改宿主的原始基因组DNA信息，但有的宿主细胞也会利用这些机制防御病毒，如基因编辑工具CRISPR/CAS，就是源于细胞的获得性免疫机制。
逆转录过程
术语解释
U3：An U3 region of 200-1.200 nt in size that contains the zone of promoters.
R：A repeated region (R).
U5：An U5 region of 75-250 nt in size, which constitutes the first portion of the retrotranscribed genome.
PBS：A sequence of 18 nt in size called Primer Binding Site (PBS) is usually observed downstream to 5'LTR, the PBS is complementary to a specific zone of the 3' end of a cellular tRNA used as primer by Reverse Transcriptase to synthesize a DNA (-) chain complementary to the R-U5 zone of 5'LTR.
PPT：Another small region of ~10 A/G called "Polypurine Tract" (PPT) is also observed upstream to 3'LTR, the PPT is responsible for the beginning of the proviral DNA strand (+) synthesis (see formative process of LTRs ).
逆转录酶 (reverse transcriptase, RT)：以DNA或RNA为模版的DNA聚合酶；
ribonuclease H (RNase H)：核糖核酸酶H，是一种核糖核酸内切酶，可以特异性地水解DNA-RNA杂合链中的RNA，常用于cDNA第二链的合成。RNase H不能水解单链或双链DNA或RNA中的磷酸二酯键，即不能消化单链或双链DNA或RNA。
逆转录过程描述
细胞内的tRNA与病毒基因组RNA的PBS区结合；
病毒RNA 5' 端的U5区和R区互补形成cDNA；
RNAse H 降解掉病毒RNA 5' 端的U5和R区；
tRNA引物携带上一步合成的R和U5区 “跳跃” 到病毒RNA的 3' 端并在R区域互补配对；
单链cDNA延伸，大部分的RNA病毒在 RNAse H 酶的作用下降解；
第一条链合成之后，第二条互补链开始合成；
tRNA 的引物部分再次 “跳跃”与合成的第一条链的PBS区域互补配对；
第一条链和第二条链进一步延伸，合成互补的dsDNA，最后在整合酶 (integrase) 的作用下整合进入宿主基因组。
【详细过程描述可参阅：Overview of Reverse Transcription;点击最下角阅读原文即可查阅】
生物信息中的逆转录
在基因组测序中，基因组装完成后通常会进行重复序列的分析，Long Terminal Repeats (LTRs) 和 Terminal Inverted Repeats (TIRs)是基因组中两类不同的重复类型，LTRs主要存在与class I 型的反转录转座子中，TIRs存在于classII 型的DNA-based 转座子中。而逆转录过程中形成的U3/R/U5区域正好是一类常见的LTRs，大多数重复序列预测分析软件也是基于这一区域的序列特征实现的。
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