肝脏菌群或是自免肝的推手？Cell子刊揭示新机制 | 热心肠日报
今天是第2198期日报。
Cell子刊：肝脏菌群失调引发Tet2缺陷小鼠的自身免疫性肝炎
Cell Host and Microbe[IF:21.023]
① T细胞缺乏Tet2可使小鼠发生由Tc1细胞（产IFNγ的CD8 T细胞）增多介导的自身免疫性肝炎（AIH）样疾病，中和IFNγ可逆转疾病进展；② 这些小鼠的发病依赖于菌群，且与肝脏菌群失调、肝内的芳香烃受体（AhR）配体产生菌增多有关，阻断AhR信号可改善疾病；③ 以产AhR配体I3A的罗伊氏乳杆菌为例，其移位入肝足以使Tet2缺陷小鼠发病；④ Tet2可限制CD8 T细胞表达IFNγ受体，抑制其过度活化，拮抗由I3A诱导的Tc1细胞分化和功能以及AIH样病理。
Tet2 deficiency drives liver microbiome dysbiosis triggering Tc1 cell autoimmune hepatitis
06-02, doi: 10.1016/j.chom.2022.05.006
【主编评语】产IFNγ的CD8 T细胞（Tc1）在自身免疫性肝炎（AIH）中起重要介导作用，但什么因素导致了Tc1的过度活化尚不清楚。Cell Host and Microbe近期发表的一项研究发现，在由缺乏Tet2（Tet甲基胞嘧啶双加氧酶2）引起的自身免疫性肝炎（AIH）小鼠模型中，肝脏内的产芳香烃受体（AhR）配体的细菌增多（如某些乳杆菌物种），这促进了AhR配体介导的Tc1细胞分化和活化，从而驱动了AIH的发生。（@mildbreeze）
Science子刊：肠道菌群如何影响造血干细胞移植预后？
Science Translational Medicine[IF:17.956]
① 在174名进行异基因造血干细胞移植（allo-HCT）的病人中发现，移植后早期较高的肠道菌群多样性，与较高的MAIT细胞和Vδ2 T细胞（γδ T细胞的主要循环亚群）的数量有关；② Vδ2 T细胞数量与MAIT细胞相关，二者均与患者较好的预后相关（如急性移植物抗宿主病发病率降低）；③ 这些免疫细胞群移植后被激活，并获得细胞毒性和效应功能；④ 特定的肠道细菌类群可产生活化MAIT和Vδ2 T细胞的代谢物，有助于在allo-HCT后维持这些细胞亚群的数量。
MAIT and Vδ2 unconventional T cells are supported by a diverse intestinal microbiome and correlate with favorable patient outcome after allogeneic HCT
05-25, doi: 10.1126/scitranslmed.abj2829
【主编评语】较高的肠道菌群多样性与异基因造血干细胞移植（allo-HCT）后较好的预后相关，但其机制尚不清楚。Science Translational Medicine近期发表的一项研究，通过分析接受allo-HCT的患者的样本，发现多样化的肠道菌群有助于维持具有保护性作用的MAIT和Vδ2非常规T细胞亚群，从而改善患者预后。（@mildbreeze）
肠道菌群调控γδ上皮内淋巴细胞
Mucosal Immunology[IF:7.313]
① 在小鼠中发现一个γδ上皮内淋巴细胞（IELs）过度增殖的新表型，该表型在生命早期出现并在整个生命中持续存在，特征为多个Vγ亚群扩增；② 菌群转移和抗生素处理实验表明，肠道菌群对γδ IELs的过度增殖表型是必要且充分的；③ 从小肠和粪便细菌中鉴定出2个功能群（共12个ASV）与γδ IELs的扩增密切相关；④ 过度增殖的γδ IELs也表现出增加的迁移行为，从而增强对沙门氏菌感染的保护作用。
A transmissible γδ intraepithelial lymphocyte hyperproliferative phenotype is associated with the intestinal microbiota and confers protection against acute infection
05-19, doi: 10.1038/s41385-022-00522-x
【主编评语】表达γδ T细胞受体的上皮内淋巴细胞（γδ IELs）是抵抗肠腔内微生物的第一道防线。Mucosal Immunology上发表的一项研究结果发现，一组特定的肠道共生菌可调控γδ IELs的增殖和行为，为增强肠上皮屏障防御带来新启示。（@mildbreeze）
上海大学：运动改善心肌梗死，肠道菌群发挥什么作用？
Microbiome[IF:14.65]
① 小鼠心肌梗死（MI）后进行运动训练能改善其心功能不全，并改变肠道菌群结构；② 用抗生素清除肠道菌群会消除运动的这种保护作用；③ 以MI后进行运动训练和不进行运动训练的小鼠分别作为粪菌移植供体，前者的菌群能更好地改善受体MI小鼠的心功能；④ 对116种粪便代谢物进行定量并结合小鼠回补实验，发现3-羟基苯乙酸和4-羟基苯甲酸介导了运动对MI小鼠的保护作用；⑤ 体外实验显示，这两种代谢物通过激活NRF2来减少心肌细胞凋亡，发挥保护作用。
Gut microbiome mediates the protective effects of exercise after myocardial infarction
05-31, doi: 10.1186/s40168-022-01271-6
【主编评语】运动有助于心肌梗死（MI）后的心脏康复，上海大学肖俊杰团队近期在Microbiome发表研究，探索了肠道菌群在其中的作用，并鉴定出有潜在保护作用的肠菌代谢物。（@mildbreeze）
乔建军+郭菲+杨爱东：构建人类肠道菌群群体感应网络
Nature Communications[IF:14.919]
① 建立一个系统工作流程，包括3个模块（收集、扩展和挖掘）和基于机器学习的4个分类器，对人类肠道菌群的群体感应（QS）通讯系统进行收集挖掘；② 基于818个人类肠道微生物，构建了包含28567条去冗余QS条目的人类肠道微生物群体感应（QSHGM）数据库；③ 借助QSHGM可以预测基于QS的微生物互作，进一步建立了可视化的QS通讯网络（QSCN），并对收集整理的9大类常见的QS进行了分析。
Machine learning aided construction of the quorum sensing communication network for human gut microbiota
06-02, doi: 10.1038/s41467-022-30741-6
【主编评语】群体感应（QS）是微生物之间交流的一种主要方式。Nature Communications近期发表了来自天津大学乔建军团队、中南大学郭菲团队、牛津大学杨爱东团队的合作研究，建立了人类肠道菌群的QS数据库（http://www.qshgm.lbci.net/）和QS通讯网络，为进一步解析肠道菌群互作、构建合成菌群和开发微生态疗法具有重要参考意义。（@mildbreeze）
肠道菌群或可用于预测早期帕金森病的进展
npj Parkinsons Disease[IF:8.651]
① 基于肠道菌群构建随机森林模型，在165名帕金森病患者中预测2年内的疾病进展；② 该模型预测Hoehn & Yahr分级1及分级2的AUROC分别为0.799及0.705，预测早期帕金森病的MDS-UPDRS III评分进展的AUROC为0.728；③ 短链脂肪酸产生菌（Fusicatenibacter菌属、粪杆菌属及布劳特氏菌属）的减少及粘蛋白降解菌（Akkermansia菌属）的增加可预测帕金森病的更快进展；④ 上述4个菌属在2年内无显著变化，提示肠道菌群变化不是帕金森病进展的结果。
Short chain fatty acids-producing and mucin-degrading intestinal bacteria predict the progression of early Parkinson’s disease
06-01, doi: 10.1038/s41531-022-00328-5
【主编评语】NPJ Parkinson's disease上发表的一项最新研究结果，在165名帕金森病患者中，基于肠道菌群构建的随机森林模型可较准确地预测2年内的疾病进展，其中，短链脂肪酸产生菌的减少及粘蛋白降解菌的增加可预测更快的疾病进展。（@aluba）
Nature Reviews：药物、天然化合物和污染物与肠道菌群的互作（综述）
Nature Reviews Microbiology[IF:60.633]
① 通过饮食和药物摄入，肠道菌群会接触大量异生物质；② 除了抗生素，靶向宿主的药物、天然食品成分和食品添加剂、农药和其他污染物等异生物质，都可影响肠道菌群的组成；③ 异生物质能够抑制或促进细菌生长、改变细菌代谢、影响肠道病毒组和肠菌毒力，肠菌反过来可对异生物质进行代谢和生物积累，从而改变其活性或毒性；④ 异生物质混合物对菌群的影响有组合效应；⑤ 应结合体外、动物模型和人群队列研究，来探索异生物质-菌群-宿主的相互作用。
Multimodal interactions of drugs, natural compounds and pollutants with the gut microbiota
01-31, doi: 10.1038/s41579-022-00681-5
【主编评语】我们每天都会摄入大量的外源物质（异生物质），如药物、食品添加剂和污染物，这些物质会影响肠道菌群的组成和功能，而菌群反过来也会影响影响这些物质对机体的作用，Nature Reviews Microbiology发表的这篇综述探讨了异生物质-菌群-宿主之间的相互作用，值得学习参考。（@mildbreeze）
肠道菌群调控IFN抗病毒免疫（综述）
Trends in Microbiology[IF:17.079]
① 肠道菌群能调节I型和III型IFN抗病毒反应，进而影响病毒感染的结局；② 肠道菌群能够调节肠内和肠外的IFN抗病毒反应；③ 机制上，肠道菌群可调控稳态下的IFN基础表达，为抗病毒反应做好准备，并通过产生特定的模式识别受体配体（如多糖A）和代谢物（如SCFA、次级胆汁酸）来诱导免疫和肠上皮等细胞表达IFN，从而调控宿主的IFN抗病毒免疫；④ 肠道菌群-IFN-病毒轴为抗病毒治疗和病毒疫苗的研发带来新启示，但在人类中的转化应用仍面临挑战。
Microbiota regulation of viral infections through interferon signaling
02-05, doi: 10.1016/j.tim.2022.01.007
【主编评语】Trends in Microbiology近期发表综述，探讨了肠道菌群在调控干扰素（IFN）抗病毒免疫反应中的作用和机制，以及在转化应用方面的前景。（@mildbreeze）
Lancet子刊：胃肠病学和肝脏病学的现状和未来
Lancet Gastroenterology & Hepatology[IF:18.486]
① 基于专家共识，对胃肠病和肝病学的6个子领域进行SWOT分析；② 目前，多种胃肠病的发病率和复杂性正在增加，新冠疫情在多层面影响患者护理，随着技术创新的出现也需要训练有素的队伍和战略规划来优化医疗资源利用；③ 未来，人工智能和大数据将加速研究发现、提供更智能的医疗服务，胃肠病学专业的发展和多样化将改善对患者的专业护理，但可能会增加护理碎片化、降低效率，还需注意对亚专科专家的需求和普通胃肠病诊疗价值间的平衡。
The present and future of gastroenterology and hepatology: an international SWOT analysis (the GASTROSWOT project)
03-02, doi: 10.1016/S2468-1253(21)00442-8
【主编评语】Lancet Gastroenterology & Hepatology近期发表的一篇观点文章，分析了胃肠病和肝病学的优势、劣势、机遇和挑战，为研究、临床和财务规划提供指导。（@mildbreeze）
感谢本期日报的创作者：一只赵崽儿呀，圆圈儿，往、昔℡，aluba，danny，赵静，Akkk
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