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文章发表:画最好看的核型图
这个RIdeogram
包在《用RIdeogram画最美的染色体 + 位点注释&表达量》一文中有介绍。看完基本上就可以了解这个包的来龙去脉。
首先当然是使用核型图,展示各种各样全基因组的位点或表达量信息。
在后续的版本中,还有新的图可以画。最主要的就是贝茲曲线(Bezier curve)比较不同基因组的同线性关系和基因顺序的异同。
然后这篇通过网络协作的文章,就在最近发表了,我作为共同通讯作者。
Citation
Hao Z, Lv D, Ge Y, Shi J, Weijers D, Yu G, Chen J. 2020. RIdeogram: drawing SVG graphics to visualize and map genome-wide data on the idiograms. PeerJ Computer Science 6:e251 https://doi.org/10.7717/peerj-cs.251
欢迎大家查阅原文,使用它去画出高颜值的图。包括各种诸如SNP,甲基化,ChIP-Seq, ATAC-Seq,miRNA, lncRNA等等。
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