查看原文
其他

DNA及RNA甲基化数据分析与课题设计学习会 (11月30-12月1日 周末 上海)

大家都知道我们生信技能树目前只有全国巡讲这个产品线是能走到所有粉丝面前的, 授课内容就是我们最擅长的R基础,Linux基础和RNA-seq实战演练。其实更多的粉丝已经跨越了入门阶段,急需高级技巧,所以我们开辟了单细胞天地公众号,不过仍然是有我抽不出精力研发的科研前沿,比如DNA及RNA甲基化数据分析与课题设计,所以我推荐专业团队来提供这个服务,报名方式见文末!

两天一夜高强度训练,理论与实战相结合


会务背景



甲基化修饰,特别是DNA中的5-甲基胞嘧啶(5mC)和信使RNA(mRNA)中的N6-甲基腺苷(m6A)的甲基化,是由S-腺苷甲硫氨酸(SAM)依赖性甲基转移酶产生。这些修饰在动植物的生命活动中发挥着重要的调节功能,并在多种肿瘤的发生发展中发挥着重要的作用。尤其是作为近年来研究热点的m6A,它是真核细胞中mRNAs丰度最高的甲基化修饰,在包括组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克以及DNA损伤应答,母本合子(maternal-to-zygotic)转化等多个重要的生物学过程中扮演重要角色。

当前高分文章发表及国家自然基金支持情况均反映DNA及RNA甲基化,尤其是m6A已成为当前学术研究的热点方向,是一个增长迅速、拥有巨大研究意义的新兴领域。鉴于DNA/RNA甲基化具有重要的临床研究意义,我们特别邀请到在该领域拥有丰富经验的专家老师为大家详细的介绍DNA/RNA甲基化的研究内容、研究方向及课题思路,并通过培训使学员熟练的掌握甲基化相关课题的数据获得和分析过程,迅速成为表观遗传领域的主力军。

 

本班特色


1、理论结合实操;

2、案例讲解分析结合;

3、协助分析学员的实际数据



内容设置


第一天上午

8:30-

11:30

DNA甲基化调控机制、科研应用及研究思路

1. 明确DNA甲基化的作用机制及调控机理。

2. 了解DNA甲基化在疾病等各研究领域中的应用。

3. 了解DNA甲基化与转录组等多组学整合分析思路。

4. 通过高分文章对DNA甲基化研究思路进行解读

5. 掌握DNA甲基化研究的多种技术方法。

     6.  了解常用DNA甲基化及疾病挖掘数据库。

理论

第一天下午

1:30-

17:00

DNA甲基化芯片及测序数据分析

1. DNA甲基化芯片及测序分析常用软件介绍。

2. DNA甲基化芯片及测序数据分析策略。

3. DNA甲基化芯片及测序分析图表解读。

4. 差异甲基化鉴定、注释及富集分析。

5. DNA甲基化芯片数据分析 (ChAMP等软件)。

6. DNA甲基化测序数据分析(bismark,methylKit等软件)。

7. DNA甲基化与转录组数据整合分析。

8. 利用公共甲基化数据完成整套甲基化分析流程。

实操

第一天晚上

18:00-21:00

RNA甲基化功能机制、研究策略及思路分析

1. RNA甲基化研究进展概述。

2. 了解RNA甲基化的概念和修饰类型。

3. 明确RNA甲基化对RNA加工代谢及生物学功能的调控机制。

4. 了解RNA甲基化在疾病等领域中的研究应用。

5. 通过高分文献思路示例及总结对RNA甲基化调控肿瘤功能研究思路进行解析。

6. 了解RNA甲基化常用的各种测序技术。

7. m6A甲基化的研究现状、思路和研究方法。

理论

第二天上午

8:30-

11:30

m6A甲基化数据分析

1. 了解各种RNA甲基化修饰谱分析技术。

2. m6A测序技术流程介绍及测序报告解读。

3. m6A常见分析内容及相关软件介绍。

4. m6A peak鉴定(R包exomePeak、MACS2)、peak差异分析(R包exomePeak)、motif分析(Homer、MEME)及peak分布(RMBase)等。

5. m6A修饰基因的功能富集分析(DAVID,Metascape、GSEA等)。

6. 预测m6A甲基化位点在线工具介绍。

7. m6A常用数据库介绍及使用(MeT-DB,m6AVar,RMBase)

实操

第二天下午

1:30-

17:00

m6A甲基化多组学整合分析,课题设计与基金申请

1.  m6A甲基化测序的项目延伸及思路拓展。

2.  m6A甲基化与多组学数据(RNA-seq,Ribo-seq等)整合分析。

3. 非编码RNA(miRNA及lncRNA等)的m6A甲基化分析。

4. 通过TGGA、ICGC数据库挖掘RNA甲基化癌症研究思路。

5.  RNA甲基化研究策略与课题设计 。

6.  RNA甲基化研究经验交流。

7.  RNA甲基化相关国自然课题的介绍。

8.  DNA及RNA甲基化基金申请思路、准备内容及方案设计注意事项等。

9.  讨论及个性化问题答疑。

理论+实操



【时间地点】

会务时间:2019年11月30日-12月1日 ,其中29日报到

会务地点:上海田林宾馆 (上海市徐汇区田林田林路)

【注册费用】

3400元/人。授课期间发放纸质邀请函(盖章)和发票。按交费先后顺序确定座位号。会务期间提供午餐,晚餐自理。

报名方式

如果确实课题有需要,跟DNA及RNA甲基化数据分析相关的朋友,直接扫码联系我即可,还可以获取一些课程外的资料!

扫下面微信二维码直接添加我好友,请注明姓名+单位+研究方向。

考虑好了再联系我,课题确实有需求才培训,其余勿扰!

    欢迎报名   

(长按图片扫描二维码可添加微信)

您可能也对以下帖子感兴趣

文章有问题?点此查看未经处理的缓存