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悄咪咪的上线了TCGA知识图谱视频教程(B站和YouTube直达)

生信技能树 生信技能树 2022-06-06

三年前就想开通一个TCGA知识图谱视频教程了,可惜一直找不到合适的机会,虽然勉强写了28篇TCGA教程:

TCGA的28篇教程-CNV全攻略

到现在TCGA计划都结束了,而且还有中国的TCGA计划的新闻出来,非常的有必要即使在每周飞来飞去进行全国巡讲的同时也抽空把视频录制务必并发布。

生信五周年-上海站 (清华北大,深圳广州站已经结束,杭州厦门郑州西安在路上)

首先,大家可以在B站看到:

https://www.bilibili.com/video/av49363776 

然后,大家可以在YouTube看到:

https://www.youtube.com/playlist?list=PLKOVv6BeGBMTbfPfxoCQHAakKQAsurjsS

目前大家能看到的是 3个单元的15集视频(4个小时教学):


接下来还有7个单元,也就是说视频完成度是30%,然后第4单元是 TCGA计划多组学分析结果解读,包括:

  • DNA Sequencing(包括全基因组和全外显子组的maf格式somatic突变数据)

  • miRNA Sequencing (表达矩阵)

  • Protein Expression(表达矩阵)

  • mRNA Sequencing(测序的表达矩阵)

  • Total RNA Sequencing(表达矩阵)

  • Array-based Expression(芯片的表达矩阵)

  • DNA Methylation (25/450/850K的甲基化芯片或者WGBS)

  • Copy Number(主要是SNP6.0芯片,还有测序后计算的拷贝数变异情况)


第5单元是,不想说了,反正没那么快,免得被别人说我吊大家的胃口。

大家先把这4个小时视频看完吧,为了防止大家不学习,我们设置了倒数机制,7天后删除一半的视频,一个月内全部删除,(*^__^*) 嘻嘻……

我坏不坏!

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