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表观组学小组开始招人啦

2017-08-12 王HH+jimmy 生信技能树

等你加入



从表观组入门生物信息学 

虽然说条条大路通罗马,但总得走一条路吧~

生物信息学的入门也是如此,据调查,19%的朋友是通过分析表观数据入门的!

而且mRNA-seq和ChIP-seq结合起来分析转录调控已经成为了主流。

现在机会来了~

生信技能树组建了从表观组开始入门生物信息学的微信交流群!

这里有小白有大神,你可以和大家尽情交流,获得JIMMY等大神的帮助,也许你是大神,也许你是刚入门的小白,现在的你在什么位置都不重要,重要的是你往什么方向走。只要你想学习,有兴趣学习,都可以加入!

我的第一次ChIP-seq实践

ChIP-seq实战分析

WGS,WES,RNA-seq组与ChIP-seq之间的异同

一篇文章学会ChIP-seq分析(上)

一篇文章学会ChIP-seq分析(下)

读 Jimmy 前辈的《Chip-seq 实战分析》后感:新司机驾考不完全指南

上面的笔记就是加入微信群的小伙伴第一步需要达到的目标,约耗时两个月,我会像转录组一样给出大纲,也会有很多小伙伴分析自己的笔记,大家一起学习。

转录组入门传送门

微信群交流什么?


1. 记录并理解一些常见的概念&技术原理

感觉做表观这些应该是必知的,也可以归纳到技能部分边练边学

  • DNA methylation 常见的reader, writer, eraser列表

  • Histone modification 同DNA methylation

  • ChIP-seq: 目前lab最最常用的技术了,大致就是通过免疫共沉淀的方法找到和某感兴趣蛋白或者修饰(通过识别该修饰的蛋白IP实现的)在基因组上的富集情况,即亲和位点

  • WGBS

2. Specific epigenetic processes

由于实验室主要做干细胞相关的如DNA methylation reprogramming, imprinting, 就稍微了解一点,但是其他的似乎也很有趣

  • paramutation,

  • bookmarking,

  • imprinting,

  • gene silencing,

  • X chromosome inactivation,

  • position effect,

  • DNA methylation reprogramming,

  • transvection,

  • maternal effects,

  • the progress of carcinogenesis,

  • many effects of teratogens,

  • regulation of histone modifications and heterochromatin,

  • and technical limitations affecting parthenogenesis and cloning



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