学院下设植物病理学系、昆虫学系和植物生物安全系3个系，拥有植物保护本科专业，以及植物病理学、农业昆虫与害虫防治、植物检疫与农业生态健康、资源利用与植物保护4个硕士和博士学位授予点。

植物保护学院历史悠久，源于清末京师大学堂农科大学，是我国植物病理学和昆虫学的主要发源地之一。植物保护学科首批入选国家重点一级学科、国家“211工程”“985工程”和“双一流”重点建设学科，一级学科学位授权点于2018年通过国际评估。植物保护专业入选国家级一流本科专业建设点、北京市重点建设一流专业，是国内首个通过中俄联合国际认证的农科类专业。

首批入选国家重点一级学科、国家“双一流”建设学科

首批入选国家一流本科专业建设点、北京市重点建设一流专业

国内首个通过中俄联合国际认证的农科类专业

拥有国家级和北京市优秀教学团队

国家级课程思政示范课程、国家级线下一流本科课程

学院拥有强大的师资队伍和雄厚的科研力量，现有：

学院是中国植物病理学会的挂靠单位，创办我国首个植物病理学科英文期刊Phytopathology Research，共同主办《植物保护学报》和《植物病理学报》，与全球30多个国家和地区的170余所大学和科研单位建立广泛稳定的合作关系。

学院拥有农业农村部作物有害生物监测与绿色防控重点实验室、农业农村部植物检疫性有害生物监测防控重点实验室和北京市种子病害检验与防控重点实验室。依托7位国家现代产业技术体系岗位科学家和3位北京市现代农业产业技术体系岗位科学家，与多地科研院所和企事业单位共建试验基地和学生实践基地。 

2023年，植物保护学院按照专业招生，专业为植物保护。

郭予元

中国工程院院士，中国农业科学院植物保护研究所原所长，两次获国家科学技术进步二等奖，获国际植物保护杰出贡献奖。

朱有勇

中国工程院院士，云南农业大学名誉校长，云南省科学技术协会主席，获“时代楷模”称号、“全国脱贫攻坚先进个人”称号。

康乐

中国科学院院士，美国国家科学院外籍院士，欧洲科学院院士，发展中国家科学院院士，国际欧亚科学院院士，非洲科学院院士，河北大学校长，获何梁何利科技进步奖、国家自然科学二等奖。

张克勤

中国科学院院士，云南大学原副校长，云南生物资源保护与利用国家重点实验室主任，获何梁何利科技进步奖、全国首届科技创新争先奖。

曾晓芃

北京市疾控局局长。曾获得“全国先进工作者”、“全国医德标兵”、 “全国职工职业道德建设先进个人”、“全国爱国卫生先进工作者”等荣誉称号。

王岩

中化资本有限公司纪委书记，曾任中种集团党委副书记、纪委书记、副总经理

张辰亮

《中国国家地理》融媒体中心主任，《博物》杂志副主编，2017年十大科学传播人物，中国科普作家协会生态专委会委员。所著《海错图笔记》获中国自然好书奖、吴大猷科普佳作奖等，被教育部列为中小学阅读指导目录图书。

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