【FAQ】百创S1000
2022年4月百迈客百创智造推出自主研发的亚细胞级别空间转录组测序技术，不仅打破了国外芯片技术的垄断，还突破了分辨率和检测通量的局限，成为国内首款“亚细胞级分辨率”和“微孔”结合的原位捕获空间转录组测序技术，全面迈入国产化的空间转录组的亚细胞技术时代。就最近大家关心的问题，我们整理了一版FAQ，分享给大家。
问
1.芯片的灵活订制是如何实现的？
答：百创S1000单张芯片上具有八个捕获区域，芯片是基于微孔微珠原理设计的，根据捕获区域的数量需求，相应的在芯片捕获区域进行处理，其他区域不做处理，从而实现灵活订制。现阶段标准品为一个捕获区域，但如有额外数量的需求可提前联系我们进行订制。问
2.百创 S1000 的多级分辨率是如何实现的？
答：我们通过将相邻的Spot位点进行组合合并分析来实现多级分辨率的调整。问
3.百创S1000的推荐样本大小情况是怎样的？
答：样本大小：≤6.8mm3，厚度满足1mm以上，最合适样本直径有4-5mm，厚度大于2mm；组织截面覆盖小于25%建议多个包埋成一个OCT包埋块，组织间隔尽量小，但是不要重叠，多个组织保持在一个水平面充分利用捕获区域。问
4.百创S1000拥有5μm级别的亚细胞分辨率，那么推荐多少的数据量？
答：我们推荐60G的Clean Data。我们对百创S1000的数据进行了测序数据的饱和度测试，发现在测序数据量达到60G时检出的基因数目趋近稳定，随着测序数据量的上升新基因被检测出的数目提高幅度微小，所以我们还是建议测60G的Clean Data。问
5.中位基因的捕获数量为多少？
答：在同一级别单位面积下（100μm直径区域），百创S1000的中位基因数与现如今主流技术所获得的中位基因数量基本一致。由于样本类型的不同，最终得到的中位基因数为1000-5000。问
6.微珠上的引物探针结构与主流技术的有何不同？
答：百创S1000上的Spatial Barcode的长度约为70个碱基，比市面上主流的要长。得益于更长的Spatial Barcode 我们的微珠种类数达到了6000万的级别，可以减少同一捕获区域Spatial Barcode的重复率。UMI的长度为12个碱基。问
7.进行贴片操作时没贴好需要修正，能贴第二次吗？
答：RESET难免会造成捕获oligo序列的丢失，从而影响最终实验的结果，所以我们是不推荐第二次贴片的。
问
8.贵公司是否提供配套的分析软件？输出的矩阵文件是否兼容第三方软件？
答：我们提供了从下机数据到基因表达矩阵整个过程的分析软件，软件是开源免费的，同时我们输出的矩阵文件完全兼容第三方软件的。问
9.目前做过的测试样本类型有哪些？
答：我们的实验人员具有丰富的实际操作经验，目前已做过肿瘤样本、胚胎样本、肝脏样本、肺部样本、脑部样本、血管样本，海洋动物等。想要了解更多百创S1000空间转录组芯片信息
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干货|百迈客单细胞 & 空间转录组专题系列
百迈客生物(BioMarker)成立于2009年5月，是一家高新技术企业，公司基于功能基因组学的BT+IT(高通量基因测序技术、生物信息技术、高性能生物云计算技术)技术，拓展出了高通量测序、生物云平台、质谱检测、智能制造四大业务板块；拥有以博士和硕士为主体的研发、生产团队；公司自成立以来，注重创新发展，科研成果成果层出不穷，先后在《Nature》、《Cell》、《Nature Genetics》等国际著名期刊上发表高质量合作文章近千篇，累计影响因子超过4500分。拥有国家发明专利技术60余项，软件著作权近200项。公司拥有Illumina、PacBio、Nanopore、BioNano、AB SCIEIX QTRAP, Waters Q-TOF等全面的测序平台，满足科研工作者多种科研需求，努力打造基因产业国际一流企业，“为世界创造新的可能！”