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黑麦基因组学研究成果《Nature Genetics》见刊国际交流会






《Nature Genetics》

论文见刊国际交流会


活动时间:3月24日 16:00—18:00









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邀请函










尊敬的老师:


我们很荣幸地邀请您参加由北京百客生物科技有限公司联合河南农业大学主办的“百迈客科研合作成果NG论文国际学术交流会”。

此次论文的发表引起了学术界和媒体界的高度关注,百迈客作为合作参与方及测序技术服务企业,为促进科研成果更广泛更科学的传播,本次特邀请到两篇论文团队一起解析黑麦基因组的奥秘。望通过这场会议进行深入学术交流,共同促进农业科学发展,为更多的科研学者提供新的研究思路。


                                         敬颂钧安


                北京百迈客生物科技有限公司&河南农业大学





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简介










黑麦(Secale cereale, 2n = 2x = 14, RR)属于禾本科小麦族黑麦属具有独特的农艺性状和基因组特性,是许多国家的宝贵作物,也是全球小麦和小黑麦改良的重要遗传资源。

2021年3月18日,国际知名期刊Nature Genetics上背对背同期发表两篇高质量黑麦基因组相关研究。分别为德国莱布尼茨植物遗传与作物研究所Nils Stein团队完成的题为“Chromosome-scale genome assembly provides insights into rye biology, evolution, and agronomic potential”论文,以及由河南农业大学王道文教授团队联合多个单位完成的题为“A high-quality genome assembly highlights rye genomic characteristics and agronomically important genes”论文,百迈客生物科技有限公司作为合作单位共同参与本项研究。





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活动议程










16:00 主持人开场、介绍会议介绍嘉宾

16:03—16:15嘉宾致辞

16:15—16:25王道文研究员 介绍整体文章

16:25—16:50 Timothy Rabanus-Wallace博士

报告题目:(Chromosome-scale genome assembly provides insights into rye biology, evolution, and agronomic potential)

16:50—16:55 线上提问环节

16:55—17:20 李广伟博士

报告题目(A high-quality genome assembly highlights rye genomic characteristics and agronomically important genes)

17:20—17:25 线上提问环节

17:25—17:50 李绪明高级工程师

报告题目:(The challenges, solutions and future for genome de novo assembly)

17:50—17:55 线上提问环节

17:55—18:00 主持人结束词

(温馨提示:本大会全程英文 文章深度解读请点击下方链接)

百迈客合作||Nature Genetics高质量黑麦基因组揭示重要的农艺基因





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活动嘉宾











郑洪坤

北京百迈客生物科技有限公司 董事长兼CEO




邓兴旺

北京大学现代农学院 院士





Nils Stein

德国莱布尼茨植物遗传与作物研究所 研究员




王道文

河南农业大学 中国科学院遗传发育所 研究员





Timothy Rabanus-Wallace 

德国莱布尼茨植物遗传与作物研究所  博士





李广伟

河南农业大学 中国科学院遗传发育所 博士





李绪明

北京百迈客生物科技有限公司 高级研发工程师







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论文介绍










论文一题目:A high-quality genome assembly highlights rye genomic characteristics and agronomically important genes

研究单位:河南农业大学 、中国科学院遗传与发育生物学研究所、北京大学现代农学院、四川农业大学及北京百迈客生物科技有限公司

主要研究内容:威宁黑麦是我国栽培的早花黑麦品种,具有抗白粉病和条锈病的能力。为了了解黑麦优良性状的遗传和分子基础,本研究结合PacBio、Illumina、Hi-C、遗传图谱、BioNano光学图谱等多种技术对威宁黑麦基因组进行组装。最终获得7.74 Gb基因组(为预估的98.47%),scaffold N50为1.04 Gb,将93.67%的序列挂载至7条假染色体上。组装的基因组经过遗传图谱、LAI(18.42)及BUSCO(96.74%)评估综合后,证明本次研究构建的黑麦基因组具有非常高的质量。本研究基于高质量的黑麦基因组揭示了全基因组基因复制对黑麦淀粉生物合成基因的影响,解析了黑麦中复杂醇溶蛋白基因座位点、控制早期抽穗性状基因的表达特征以及黑麦中与驯化相关的染色体区域和基因座,并首次发现开花基因(FT)磷酸化对开花时间控制的影响,为更全面地探索FT基因控制植物开花的分子和生化机制提供了新的途径。本次研究成果对黑麦功能基因组的深入挖掘及黑麦及相关谷类作物的遗传改良将产生巨大的推动作用。

论文二题目:Chromosome-scale genome assembly provides insights into rye biology, evolution, and agronomic potential

研究单位:德国莱布尼茨植物遗传与作物研究所,Nils stein教授团队

主要研究内容:作者通过短读长测序结合染色体特异性鸟枪法(CSS)、Hi-C、10×Genomics、遗传图谱及光学图谱等技术组装出了6.74 Gb染色体水平基因组。基于该基因组,在本研究探索了黑麦基因组扩张缘由,基因间空间的演化,相关结构变异与小麦族基因组的进化,以及黑麦抗病和抗逆的遗传基础。本次对抗病、耐低温和杂交育种的育性控制系统有关的黑麦基因家族研究,将有助于揭示黑麦与大麦和小麦性状差异的基因组学基础,促进黑麦以及小麦和小黑麦的作物改良,为后续分子育种提供基础数据。





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团队介绍










河南农业大学“植物基因组学和分子育种” 研究团队组建于2017年4月,其主要研究方向是深入解析植物重要生命过程以及小麦等作物关键农艺性状控制的分子机理,发掘具有科学意义和育种实用价值的基因与优良变异。王道文教授以第一或通讯作者身份在SCI刊物 (Nature、Science、Nature genetics、PNAS、Plant Cell、Plant Journal、New Phytologist、Molecular Breeding等) 发表论文50余篇,获国家杰出青年基金支持,获得中华农业科技奖一等奖1项 (第二完成单位和第二完成人)。现主持国家重点研发计划项目“主要农作物品质性状形成的分子基础”的研究,并担任核心期刊“作物学报”常务编委、SCI刊物Scientific Reports编委。


德国莱布尼茨植物遗传与作物研究所Nils Stein教授团队专注于麦类基因组学相关领域研究,主要涉及大麦、小麦、黑麦遗传多样性、PGRFA、病毒抗性、大麦突变体等方向。Nils团队在Nature、Cell、Nature Genetics、Genome Biology、Nature Communications、Molecular Plant等国际顶级期刊上共发表论文约500余篇。2020年Nils Stein教授在国际顶级杂志Nature上同期发表大麦与小麦两篇高水平泛基因组研究论文,引起了科研行业内的广泛关注。

北京百迈客作为基因行业的先行者,一直把“持续创新”作为公司发展的核心价值观,用创新驱动公司发展。尤其在三代测序和大数据分析方面,拥有数十项发明专利。目前已经在国际顶级学术刊物发布论文近千篇,影响因子累计3000分以上。希望可以依托于公司在三代测序和云平台方面的领先优势,为国内外同仁在基因研究方面提供高效的服务,发现更多基因数据背后的‘知识’,利用云平台充分挖掘基因数据更深层次的价值,和大家一起让基因技术更多服务社会,造福人类。





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活动报名










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期待您的参与



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