百迈客2019年转录调控成功案例盘点——农学篇
一元伊始，万象更新。不知不觉间，百迈客陪伴大家从10时代跨越到新的20时代。据不完全统计，截至目前转录调控组学合作文章共494+篇，涉及mRNA、miRNA、lncRNA、circRNA、全转录组、全长转录组、原核转录组、蛋白组、代谢组、全基因组甲基化、降解组等多种测序分析技术，累计影响因子1630+，5分以上文章共49篇。
回首走过的2019年，百迈客与全国科研学者齐心合作，在农学转录调控组学的研究取得了优异的成绩，可谓收获颇多，其科研成果在全球知名杂志上发表多篇界内高质量科研文章。仅一年时间，共计发表文章152篇，累计影响因子529+，覆盖作物、林木、中药、花卉、畜禽、水产、昆虫及微生物等多个物种领域研究，其中5分以上文章共18篇，见刊于《Cell Host & Microbe》、《Microbiome》、《The Plant Cell 》、《Journal of Hazardous Materials》、《New Phytologist》、《Bioresource Technology》等界内高水平杂志。
案例一
中文题目：拟南芥锌指蛋白1在GL2下游通过直接抑制bHLH基因来抑制根毛的起始和伸长
英文题目：Arabidopsis ZINC FINGER PROTEIN1 Acts Downstream of GL2 To Repress Root Hair Initiation and Elongation by Directly Suppressing bHLH Genes
杂志名称：The Plant Cell
影响因子：8.631
合作单位：山东师范大学
概要：该研究首次揭示了拟南芥C2H2型锌指蛋白基因AtZP1在根毛命运决定开关GL2的下游通过直接负向调控bHLH型基因RHD6，RSL4和RSL2决定根毛的起始和伸长。
案例二
中文题目：miR6443通过调控阿魏酸-5-羟化酶的表达调控杨树木质素单体合成
英文题目：MicroRNA6443‐mediated regulation of FERULATE 5‐HYDROXYLASE gene alters lignin composition and enhances saccharification in Populus tomentosa
杂志名称：New Phytologist
影响因子：7.299
合作单位：西南大学
概要：该研究揭示了microRNA6443通过转录后调控阿魏酸-5-羟基化酶基因F5H表达，实现对杨树木材中木质素单体合成的精准调控。
案例三
中文题目：通过控制授粉来干预同化物的竞争，可以防止玉米授粉后干旱时期的种子败育
英文题目：Intervening in Sibling Competition for Assimilates by Controlled Pollination Prevents Seed Abortion under Postpollination Drought in Maize
杂志名称：Plant Cell & Environment
影响因子：8.631
合作单位：中国农业大学
概要：该研究以玉米为材料，系统性地总结和阐述了花期干旱胁迫诱导籽粒败育问题的复杂性，并提出了一个干旱诱导受精后籽粒败育机制的模型，为通过育种或栽培手段减少生产中籽粒损失提供了理论依据
据不完全统计，2019年植物类文章见刊共计83篇，累计影响因子314+。
植物类部分成功案例列表
动物篇
案例一
中文题目：瘤胃微生物群与宿主互作刺激羔羊瘤胃上皮细胞的发育
英文题目：Ruminal microbiome-host crosstalk stimulates the development of the ruminal epithelium in a lamb model
杂志名称：Microbiome
影响因子：10.465
合作单位：南京农业大学
概要：本研究较全面地描述了早期饲喂开食料羔羊瘤胃微生物群与寄主之间的互作共生关系。结果表明，微生物菌群促进淀粉的降解和乙酸与丁酸的生成，乙酸和丁酸可通过调控与瘤胃上皮发育相关的分子通路，促进瘤胃上皮生长。宿主及其微生物群的共同发育机制，为反刍动物幼龄的瘤胃发育调控提供了新视角。
案例二
中文题目：1-十二烯暴露后寄生蜂白蛾周氏啮小蜂（Chouioia cunea）的全长转录组研究及表达分析
英文题目：Full-Length Transcriptome Survey and Expression Analysis of Parasitoid Wasp Chouioia cunea upon Exposure to 1-Dodecene
杂志名称：Scientific reports
影响因子：4.011
合作单位：天津师范大学
概要：白蛾周氏啮小蜂是一种寄生于蛹内的寄生蜂，对白蛾的生物防治起着重要的作用。本研究通过2+3全长转录组学技术，鉴定到成年啮小蜂中对1-十二烯的响应与某些蛋白的跨膜信号转导和去磷酸化基因通路有关。为进一步研究宿主识别的分子机制提供有益的参考。
案例三
中文题目：罗非鱼肝脏在急性氨暴露下的转录组和代谢组响应
英文题目：Differential Transcriptomic and Metabolomic Responses in the Liver of Nile Tilapia (Oreochromis niloticus) Exposed to Acute Ammoni
杂志名称：Marine Biotechnology
影响因子：2.798
合作单位：中山大学
概要：罗非鱼是世界上最重要的养殖鱼类属之一，在高密度养殖系统中，氨可以迅速累积到危险甚至致命的水平。提升罗非鱼的抗氨胁迫能力已成为罗非鱼育种的重要问题。该研究通过多个处理多个时间点探究氨胁迫下转录水平和代谢物水平的响应变化，将差异基因和差异代谢组共同映射到通路中，从功能注释方面充分证明在氨胁迫过程的重要作用。
2019年动物类文章的产出也是比较喜人，共计见刊55篇文章，其中经济动物类28篇，昆虫类15篇，水产类12篇，累计影响因子158+。
动物类部分成功案例列表