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官宣丨Nanopore全长转录组实测数据公布

北京今天有点霾,不是很晴朗,小编今天的心情也是灰蒙蒙的!!

从今年8月开始,我们就开始了Nanopore全长转录组的推广,也在业界激起了千层浪。推广的顺利进行,离不开我们各个业务线的积极全力配合,从生产到研发,投入了大量的人力和物力,一步一个脚印,无不在加班加点。截至目前,Nanopore全长转录组已搭建了较为成熟的建库测序和信息分析流程,以致力于将最前沿的测序技术提供给科研者。

然而,这两天小编看到某不良竞争公司不官宣,不推公众号,却在朋友圈疯狂diss我们,散布虚假信息,小编甚感委屈,对于无良公司故意诋毁,百迈客声明如下:

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关于百迈客Nanopore研发时间问题

自2017年8月百迈客开始进行ONT平台的研发,前期更多是在MinION和GridION两种仪器平台上进行摸索。到今年8月PromethION平台到达公司,完成全测序平台搭建,已经过去一年多时间。本着对科研老师负责的态度,我们对该技术有了将近一年的沉寂,直至流程的研发与建立,我们才开始正式在市场推广。回顾近两年对Nanopore的宣传,确实在基因组上大放异彩,而其测序原理的复杂性,也使得Nanopore全长转录组测序比Pacbio复杂的多。迎难而上,才是对科学研究应有的态度,有坑不怕,坑多也不怕,我们要做的不是逃避,而且尽全力去解决,做第一个敢于吃螃蟹的人!

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关于百迈客Nanopore全长转录组结题报告

对于某无良竞争公司diss我们的结题报告数据是真实项目问题,在此声明如下:

为了对客户科研成果保密,在目前更新的所有转录组产品的结题报告模板中,我们均使用示例数据,绝对不是老师真实项目实测数据目的是方便各位科研工作者了解百迈客每个产品的分析内容。因内部沟通不及时而给各位科研工作者带来的困扰,我们深表歉意。

科研是一件严肃的事情,我们不靠嘴上功夫,会用实力去抵制无良的恶性竞争,下面小编带大家一起看一下百迈客Nanopore全长转录组研发实力和成果。

1、今年9月,公司通过牛津纳米孔公司(Oxford Nanopore Technologies,ONT)官方认证,成为中国大陆第一家有RNA测序资质的公司(https://nanoporetech.com/services/providers)。这在全球也仅12家公司有该资格,功夫不负苦心人,我们的努力终于得到认可。

图1. ONT官方认证

2、从8月推广至今,大家在官网、公众号上一直未见测试数据的公布。今天,借此机会,把我们的实测数据公布,给大家吃一个定心丸。

测试数据使用一个flow cell进行上机测序,raw data数据量在2.5~4.4Gb,reads数为2.8~3.9M,其中N50在1.5kb左右,平均长度为1.0kb,平均质量值Q7以上。在对其进行质控后,其基因组比对率在85%左右

表1. 实测Nanopore全长转录组数据

在我们的推广中,曾说Nanopore转录组可不使用二代测序数据进行定量分析,因此,测序的数据量必定得达到饱和,定量才会准确。而从我们目前的测试数据看,不同片段长度的转录本均已达到饱和,因此,使用Nanopore进行定量分析是完全可以做到的。

   图2.质控标准

     图3.转录本饱和度图  

3、百迈客云平台是由北京百迈客生物科技有限公司开发,集成生物信息分析软件、数据库以及云计算为一体的生物数据信息分析平台。百迈客云分析集成的标准分析流程及个性化分析工具,实现云平台极速标准分析、个性化实现交互性、可视化、实时查看的优势,提供从建库测序到文章发表的一站式服务平台。

可喜可贺的是,经过百迈客转录调控事业部信息研发不断努力,Nanopore全长转录组APP已完成开发处于大测阶段,并将于11月与大家见面,以下是APP界面展示,先带大家提前领略一下它的风采,Nanopore云APP,能够带您体验即可极速标准分析,自主进行个性化深入数据挖掘。

图4.Nanopore全长转录组APP展示

图5.Nanopore全长转录组APP操作步骤展示

OK,以上就是今天小编要讲的两部分,第一部分就是针对无良公司的恶意诋毁,作出的郑重声明,第二部分就是我们Nanopore全长转录组最新研发数据公布,各位科研学者如有疑问,欢迎随时咨询,咨询热线:400-600-3186。

还是那句话,我们的实力在这摆着呢,相信大家的眼睛是雪亮的,本着科研初心,百迈客宗旨“开拓创新,追求卓越”不断提升自己,突出自己的优势,不诋毁同行,做有素质的科研服务者。

历经此番风波,希望业界同行能公平竞争,一起进步,为中国的科学研究提供一片净土,为中国的科研创新一起添砖加瓦,贡献自己的一份力量。


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